Struktur ini dipengaruhi oleh gaya seni Fatimiyah, dengan siling nave mengambil daripada seni Fatimiyyah melalui penggunaan muqarnas.[3] Nave adalah serupa dengan dewan resepsi Islam dengan kehadiran siling dan gerbang berkubah muqarnas di sepanjang tiang.[4] Terdapat juga petunjuk Kufic dalam Cappella Palatina, namun ini sangat diperdebatkan. oleh ulama kerana prasasti tersebut telah dihapuskan kemudian.[5] Diperkirakan kemungkinan prasasti Kufic ini dimaksudkan untuk struktur kerana kehadiran prasasti Kufic dalam struktur lain yang dibina untuk atau oleh Raja Roger II.[6] Cappella Palatina ialah juga dipengaruhi oleh gaya Islam yang mempunyai corak rectilinear, tidak biasa kepada seni Eropah pada masa itu.[7]

Beratus-ratus aspek siling Muqarnas telah dicat, terutamanya dengan banyak reka bentuk tumbuh-tumbuhan dan zoomorphic hiasan semata-mata tetapi juga dengan adegan kehidupan seharian dan banyak subjek yang masih belum dijelaskan. Dipengaruhi secara gaya oleh Seni Fatimid Mesir, lukisan ini adalah inovatif dalam representasi tokoh dan haiwan yang lebih spatial.

Kebanyakan muqarna diperbuat daripada stuko atau batu tetapi muqarna di Cappella Palatina dibentuk dan diukir dengan kayu.[8] Terdapat panel berbentuk gerbang sebagai binaan utama dan panel tersembunyi yang membantu pusat pemotongan kayu untuk peti besi kecil di muqarnas.[8] Muqarnas mempunyai 5 peringkat mendatar yang membolehkan peralihan yang lancar dari siling ke dinding nave.[9] Siling disokong oleh acuan kayu cavetto mendatar yang menyentuh bahagian atas tingkap.[9] Terdapat 8 titik bintang di siling nave yang dicipta dengan lapisan dua segi empat sama pada sudut 45 darjah.[9] Siling muqarnas dibina kemungkinan besar selepas mozek nave yang ditempah oleh William I.[10]